В соответствии с директивой Министра обороны Российской Федерации от 2 февраля 2011 г. 1 февраля 2012 г. сформирован Организационный отдел Аппарата Министра обороны Российской Федерации.

Директивой Министра обороны Российской Федерации от 15 ноября 2012 г. Организационный отдел Аппарата Министра обороны Российской Федерации переформирован в Организационное управление Министерства обороны Российской Федерации.

Организационное управление Министерства обороны Российской Федерации предназначено для организации всестороннего обеспечения служебной деятельности Министра обороны Российской Федерации и должностных лиц Аппарата Министра обороны Российской Федерации.

Организационное управление Министерства обороны Российской Федерации выполняет задачи и функции в соответствии с Положением об Организационном управлении Министерства обороны Российской Федерации, утвержденным приказом Министра обороны Российской Федерации от 2013 г. № 215.