I. Кафедры теоретического профиляII. Кафедры клинического профиля (клиники)
Кафедра авиационной и космической медицины
Кафедра автоматизации управления медицинской службой (с военно-медицинской статистикой)
Кафедра биологии имени академика Е.Н. Павловского
Кафедра биологической и медицинской физики
Кафедра военной психофизиологии
Кафедра военной токсикологии и медицинской защиты
Кафедра гистологии (с курсом эмбриологии)
Кафедра гуманитарных и социально-экономиноческих дисциплин
Кафедра иностранных языков
В стадии разработки
Кафедра клинической биохимии и лабораторной диагностики
Кафедра микробиологии
Кафедра нормальной анатомии
Кафедра нормальной физиологии
Кафедра общей и военной гигиены (с военно-морской и радиационной гигиеной)
Кафедра общей и военной эпидемиологии
Кафедра общественного здоровья и экономики военного здравоохранения
Кафедра оперативного искусства
Кафедра оперативной хирургии (с топографической анатомией)
Кафедра организации обеспечения медицинским имуществом войск (сил)
Кафедра организации и тактики медицинской службы
Кафедра организации и тактики медицинской службы флота (с курсом тактики и боевых средств флота)
Кафедра патологической анатомии
Кафедра патологической физиологии
Кафедра педагогики
Кафедра русского языка
Кафедра физиологии подводного плавания
Кафедра физической подготовки
Кафедра химии
Первая кафедра и клиника терапии усовершенствования врачей имени академика Н.С. Молчанова
Первая кафедра и клиника хирургии усовершенствования врачей имени П.А. Куприянова
Вторая кафедра и клиника терапии усовершенствования врачей
Вторая кафедра и клиника хирургии усовершенствования врачей
Кафедра и клиника акушерства и гинекологии имени А.Я. Крассовского
Кафедра и клиника амбулаторно-поликлинической помощи
Кафедра и клиника анестезиологии и реаниматологии
Кафедра и клиника военно-морской терапии
Кафедра и клиника военно-морской хирургии
Кафедра и клиника военно-полевой терапии
Кафедра и клиника военно-полевой хирургии
Кафедра и клиника военной травматологии и ортопедии имени Г.И. Турнера
Кафедра и клиника госпитальной терапии имени профессора В.Н. Сиротинина
Кафедра и клиника госпитальной хирургии
Кафедра и клиника детских болезней имени М.С. Маслова
Кафедра и клиника инфекционных болезней (с курсом медицинской паразитологии и тропических заболеваний)
Кафедра кожных и венерических болезней
Кафедра курортологии и физиотерапии (с курсом медицинской реабилитации)
Кафедра нейрохирургии
Кафедра и клиника нервных болезней имени М.И. Аствацатурова
Кафедра нефрологии и эфферентной терапии
Кафедра общей хирургии
Кафедра отоларингологии
Кафедра офтальмологии
Кафедра и клиника пропедевтики внутренних болезней
Кафедра и клиника психиатрии
Кафедра и клиника рентгенологии и радиологии
Кафедра судебной медицины (с моргом)
Кафедра и клиника терапевтической стоматологии
Кафедра и клиника термических поражений и пластической хирургии
Кафедра и клиника урологии
Кафедра и клиника факультетской терапии имени С.П. Боткина
Кафедра и клиника факультетской хирургии имени С.П. Федорова
Кафедра фармакологии
Кафедра и клиника фтизиатрии
Кафедра и клиника челюстно-лицевой хирургии и стоматологии