Organizaciones filiales
En la actualidad, son filiales de la Organización Nacional Indígena de Colombia cuarenta y siete (47) organizaciones zonales y regionales, que se encuentran en 28 de los 32 departamentos del país. A continuación se presentan clasificadas por macro-regionales.
Macro Amazonía
- Asociación de Autoridades Indígenas de la Pedrera Amazonas – AIPEA.
- Asociación de Autoridades Indígenas de Tarapacá Amazonas – ASOAINTAM.
- Asociación de Autoridades Indígenas Ticunas, Cocamas y Yaguas -ATICOYA.
- Asociación de Cabildos Indígenas del Trapecio Amazónico – ACITAM.
- Asociación Zonal del Consejo de Autoridades Indígenas de Tradición Autóctono – AZCAITA.
- Asociación Zonal Indígena de Cabildos y Autoridades Tradicionales de la Chorrera – AZICATCH.
- Cabildo Indígena Mayor de Tarapacá – CIMTAR.
- Cabildo Mayor Kamentsá Biya-Alto Putumayo y Comunidad Indígena Kamentsá Biya Aguacat Buyesh-Bajo Putumayo.
- Consejo Indígena Mayor del Pueblo Murui – CIMPUM.
- Consejo Regional Indígena del Orteguaza Medio Caquetá – CRIOMC.
Macro Centro – Oriente
- Asociación de Autoridades Tradicionales del Consejo Regional Indígena del Tolima – CRIT.
- Asociación de Autoridades Tradicionales del Pueblo Barí – ÑATUBAIYIBARI.
- Asociación de Autoridades Tradicionales y Cabildos U’wa – ASOU’WA.
- Cabildo Indígena Embera Chamí – Comunidad Dachi Drua.
- Pueblo Muisca de Bosa, Suba, Cota, Sesquilé y Chía.
Macro Norte
- Asociación de Autoridades y Cabildos Indígenas Wayúu del Sur de La Guajira – AACIWASUG.
- Asociación de Jefes Familiares Wayúu de la Zona Norte de la Alta Guajira – WAYÚU ARAURAYU.
- Asociación Indígena de La Guajira – Waya Wayúu.
- Cabildo Indígena del Resguardo Mayabangloma.
- Cabildo Mayor Mokaná del Atlántico.
- Cabildo Mayor Regional del Pueblo Zenú de Córdoba y Sucre
- Organización Indígena de La Guajira – YANAMA.
- Organización Indígena Kankuama – OIK.
- Organización Wayúu Painwashi.
- Organización Wiwa Yugumaiun Bunkuanarrua Tayrona – OWYBT.
- Organización Indígena Yukpa.
- Pueblo Ette Enneka-Chimila.
- Resguardo Quebrada Cañaveral del Alto San Jorge.
Macro Occidente
- Asociación de Cabildos Indígenas de Antioquia-Organización Indígena de Antioquia – OIA.
- Asociación de Cabildos Indígenas del Valle del Cauca Región Pacífico – ACIVA RP.
- Asociación de Cabildos Indígenas Embera Chamí, Katío, Dule y Wounan del departamento del Chocó – ASOREWA.
- Asociación de Cabildos Indígenas Eperara Siapidara de Nariño – ACIESNA.
- Cabildo Mayor Awá de Ricaurte – CAMAWARI.
- Cabildo Mayor Embera Katío del Alto Sinú – CAMAEMKA.
- Consejo Regional de Autoridades Indígenas de Risaralda – CRIR.
- Consejo Regional Indígena de Caldas – CRIDEC.
- Consejo Regional Indígena del Cauca – CRIC.
- Consejo Regional Indígena del Chocó – CRICH.
- Consejo Regional Indígena del Huila – CRIHU.
- Federación de Asociaciones de Cabildos Indígenas del Departamento del Chocó – FEDEOREWA.
- Organización Regional Indígena del Quindío – ORIQUIN.
- Organización Regional Indígena del Valle del Cauca – ORIVAC.
- Unidad Indígena del Pueblo Awá – UNIPA.
Macro Orinoquía
- Asociación de Autoridades Indígenas Tradicionales UNUMA.
- Asociación de Cabildos y Autoridades Tradicionales Indígenas del Departamento de Arauca – ASCATIDAR.
- Consejo Regional Indígena del Vichada – CRIVI.
- Organización Regional Indígena del Casanare – ORIC.
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